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青稞基因组图谱全球首发 有助于作物适应性机制研究

http://www.chla.com.cn 2017-01-17 来源:广州日报 作者: 发表评论(0)

  近日,全球首个青稞基因组图谱正式绘制成功,其研究成果在线发表在国际著名期刊PNAS杂志上,该研究对青稞的西藏地方品种LasaGoumang进行了全基因组测序及图谱绘制,有助于高原作物的适应性机制研究。

  研究构建图谱占青稞基因组的87%

  青稞经过藏族人民长达3500~4000年的驯化栽培,已经完全适应了极端的高原气候,成了藏族人民的主食。据悉,西藏地区的青稞种植面积占西藏耕地面积的70%。西藏自治区农牧科学院、西藏自治区大麦和牦牛培育重点实验室、中国科学院、深圳华大基因研究院及华大科技等在内的众多研究机构,于2012年正式启动了青稞基因组研究合作项目,以揭示青稞的高原适应性机制,解读其起源、驯化及栽培选育过程。

  1月13日公布的全球首个青稞基因组图谱,对青稞的西藏地方品种LasaGoumang进行了全基因组测序及图谱绘制,获得了基因图谱,共包含36151个蛋白编码基因。据估计,青稞基因组大小约为4.5Gb,本次研究所构建的青稞基因组图谱大小为3.89Gb,共占青稞基因组的87%。

  有助于改良高原类植物

  对于人们最感兴趣的青稞的高原适应性机制问题,此次研究人员也做了专门研究,并发现了一系列在青稞品种中发生了正向选择的基因家族。如,调节转录过程的基因家族,激活转录因子的基因家庭,防御反应相关的基因家庭等都得到了大量的扩张,这些基因家族的扩张使得青稞在面对高原的恶劣环境时具有更大的调节弹性,从而具有更好的适应性。

  华大基因该项目负责人赵山岑表示,作为麦族的重要一员,青稞基因组的发表,不但帮助人们更好地理解大麦类作物的不同驯化途径,同时也使得我们能够结合大麦、小麦及其祖先品种一窥麦族的进化历史,“而青稞在耐寒缺氧等极端环境的适应性问题,更好地为我们进行高原类作物的改良指明了方向,有助于解决民生中的粮食问题。”

  

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编辑:guoai
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