黑龙江省红旗湿地自然保护区管理局是隶属黑龙江省孙吴县县政府，保护区于2005年开始筹建，以维护黑龙江流域生态系统稳定。保护区位于孙吴县城西部，地处孙吴县林业局红旗林场施业区内，东西均与孙吴县红旗林场接壤，南与孙吴县正阳林场相连，北至红旗林场场部。保护区总面积为21283公顷，其中湿地面积为7624公顷，占保护区总面积的35.8%。黑龙江省红旗湿地自然保护区属于内陆水域与湿地生态系统类型自然保护区，是黑龙江流域重要的林间湿地生态系统，承担着下游的补水、维持流域的水平衡，调节流量、控制洪水等生态服务功能，进而对黑龙江流域的水土保持、水源涵养等均具有重要作用。黑龙江红旗湿地自然保护区地处大兴安岭与小兴安岭的过渡地带，保存着完好的高纬度地区林间湿地及次生林森林资源，生物多样性丰富，共有高等植物500余种，分属100余科，兽类6目15科48种。

　　黑龙江省林业厅高度重视“黑龙江红旗湿地保护与恢复项目”争取国家2013年建设投资工作，积极组织力量，高效率完成该项目各项材料的审核工作，积极协调省发展和改革委员会落实项目呈报批件，在国家发改委要求时限内高质量编制完成该项目2013年底资金申请报告，派专人进京向国家发改委、国家林业局有关司局汇报项目情况、呈报项目材料。工程总投资为896.42万元，其中中央投资358.568万元，占总投资的40%；地方投资537.852万元，占60%。项目建设成后将及大改善保护区基础设施条件。目前，该项目已顺利完成呈报工作。