云南完成全球首个兰科植物基因组测序
9月4日上午,云南完成全球首个兰科植物基因组测序科技成果新闻通气会在云南普洱市举行。该项目组用一年半时间,完成了铁皮石斛全基因组测序工作,绘制了国际上首个兰科植物的全基因精细图谱。
目前,测序深度已达铁皮石斛基因组大小的200倍,测序结果已覆盖95%的全基因组和97%的基因编码区,超过国际上同行复杂基因测序的最高水平。研究组进一步解析了铁皮石斛基因组中的基因信息,发现了48200多个蛋白质编码基因,其基因数目是目前所有已经测序的植物中最多的,从基因水平证实了铁皮石斛在植物学中处于高等植物的地位。
作为联盟成员单位的云南农业大学联合普洱市普洱茶研究院,以云南农业大学盛军校长(普洱市副市长)、昆明动物研究所王文研究员为课题组组长,全面展开了云南铁皮石斛基因组计划的实施。使用目前最新的第二代测序技术和近期刚刚引入国内的第三代单分子测序技术,完成了铁皮石斛全基因组测序工作。
云南农业大学盛军校长表示,铁皮石斛成为国际上第一个拥有基因组精细图谱的兰科植物,也是第一个进行全基因组测序的药食同用植物;同时,也是云南省主导完成的第一个植物基因组。铁皮石斛基因组精细图谱的绘制完成,标志着兰科植物研究进入基因时代,同时也开启了国际药食同用植物基因组研究的新纪元。
该项目的另一负责人王文研究员从基础研究层面充分肯定了铁皮石斛基因组的意义,他认为,铁皮石斛基因组作为第一个发布的兰科植物基因组,将为兰科植物的起源、演化和特性研究提供最基础数据,作为第一个被解析的药食同用植物基因组,也将进一步提振中药的国际知名度,促进中草药的现代化。
2012年1月,在云南省科技厅的支持下,云南省成立了石斛产业技术创新战略联盟,并设立专项经费开展了云南铁皮石斛地理标志研究、云南铁皮石斛质量标准研究、云南省石斛科技产业发展规划以及铁皮石斛基因组计划等课题。
据介绍,兰科植物是在植物分类学中处于最高等地位的一类植物,对兰科植物的研究被誉为植物学研究的“顶峰”。兰科植物大多属于濒危物种,而作为“植物王国”的云南,汇聚了中国大多数兰科植物。近年来,云南省在兰科植物的研究、保护和开发利用方面取得了众多成果,铁皮石斛就是其中的代表之一。
编辑:zhufei
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