目前，珠江水利委员会（下称“珠江委”）每年均对珠江流域2万多公里的主要河段进行监测、评价，从多年的监测、评价结果来看，整个珠江流域水体水质保持在Ⅰ至Ⅲ类水标准以上的河长达到70%以上，Ⅳ、Ⅴ类水占不到20%，劣Ⅴ类水体只有很少的河段，污染河段主要集中在珠江的上游与珠江三角洲，俗称污染在“两头”。

　　不过，也有专家指出，珠江口水质“极差”有评价指标的差异。珠江委对珠江口有着长达30年的监测。李学灵称，珠江出海口的水质还是不错的。以2013年12月的监测数据为例，八个出口中，有好几个口门都达到了地表水Ⅱ类水的水质标准，只有一个口门的石油类指标出现超标现象。

　　李学灵指出，环保部公报的珠江口水质评价数据主要是珠江口近岸海域的数据，而海水和地表水的评价指标体系、分析方法与标准均不同，所以珠江口八大口门地表水质评价结果与近岸海域海水评价结果表面上看存在一些差异也是正常的。

　　主因是陆源排污

　　多位专家均表示，珠江口长期严重污染，罪魁祸首是陆源大量排污。

　　中山大学环境科学研究所一篇名为《珠江口水环境可持续发展的探讨》的论文中提到，淡水径流是珠江口污染物的主要来源。从最近几年的研究中发现，珠江径流入海污染物主要有有机物、汞、石油、无机氮、无机磷等。通过八大口门进入珠江口的有机物占河口总来源的80%以上。

　　这篇论文还提到，近年工业废水直接排海量比以往有所减少，但生活污水和海上污染物排放量却有增加趋势。随着沿海经济的发展，污染物排海量近期内不会有明显的减少，特别是新的难降解有机污染物入海量将呈增加趋势。

　　中山大学环境科学与工程学院教授李适宇指出，虽然氮、磷本身不是有毒物质，但是超标会造成富营养化。氮在降解的过程中会消耗氧，会促进浮游植物的繁殖，使藻类疯长。

　　广东省海洋与渔业局根据近10年监测数据比较分析，珠江口海域的污染面积和程度总体上保持稳定，但富营养化仍是珠江口海域海水水质面临的最主要问题。珠三角人口稠密、经济发达，沿途接纳的工业、种植、畜牧和生活污水通过珠江八大口门随径流进入珠江口海域共同构成污染。

　　多位专家表示，要科学评估珠江口的承受能力，给出各河流允许的入海污染物容量，从陆源污染控制中，实施入海污染物总量控制制度对保护近岸海域水体质量是十分有效的办法。

　　这也是珠江委目前正在做的事情。李学灵告诉《第一财经日报》，珠江委根据各个水功能区的不同要求，制定了各水功能区的限制纳污排放总量。目前这份报告已经流域内各省有关部区协调，上报水利部，正等待国家批准。如果那个河段排污总量超过了限制排污总量，可以通过区域限批等手段来要求地方进行整改。

　　珠江委水源局另一名教授级高工刘晨告诉本报记者，2005年水利普查的数据显示，珠江流域主要排污口有8000多个。目前珠江委在大的排污口都分布有监测点。