建于1965年，前临光华岛，后依青龙山，为一仿唐式建筑。该寺地理风水称该寺占“青龙戏珠”宝地，庙分两层，分别供奉玄奘舍利子与释迦牟尼佛金身。

　　玄奘为唐朝高僧，受唐太宗之命前往印度取经，经十余年返国，得经书六百五十余部，与其弟子共译七十五部，得一千三百三十五卷，对佛教在中国的发展贡献卓著。中日战争期间，日人在南京掠走玄奘大师的灵骨，供奉在日本琦玉县慈恩寺，1955年，始迎灵骨回国，供奉于日月潭畔之玄光寺，1965年11月，玄奘寺建成后，灵骨才迁迎入。

　　玄奘寺正方形的地砖散发着光滑与朴实感。寺内“国之环宝”匾额乃先总统蒋公亲题，寺外墙上，刻有玄奘西域游行图与碑文三座；左为中日亲善纪念，中有玄奘法师传记，右则中日佛教亲善交流纪念碑。此外，门前尚有两尊石象，殿前有大鼓一座，登梯而上可见供人敲槌之醒钟。