沈阳故宫在被列入《世界遗产名录》后，迎来了首次大修。2008年6月2日，沈阳市建委公布了此次沈阳故宫的修缮方案，故宫内九成以上的建筑将重新修饰。

　　“这次修缮是因为在申遗时曾经做出的承诺，将要在6年内对‘一宫两陵’进行一次全面修缮，沈阳市将出资4亿元进行大规模维修。”2008年6月5日，沈阳市建委城建处副处长石国琦说，此次修缮工程的重点是地仗、屋面查补、石墁砖墁替补及门窗、墙面油饰工程。除了已经在去年修缮完毕的嘉荫堂、戏台、飞龙阁和翔凤阁外，故宫其余建筑将全部在此次修缮的范围内。其中，崇政殿和大政殿被列为重点，将对房面进行检查，补充琉璃瓦，清理房面杂草、油饰等。

　　此次修缮本着尊重历史、绝不改变历史原貌的原则，将对沈阳故宫内建筑的瓦顶、木构架、木基层、木装修、墙体、地面、地仗油饰等7个方面进行维护。